Ferrari od początku chciało oferować model 456 także ze skrzynią automatyczną - w końcu w przypadku poprzedników wybierało ją aż 2/3 klientów. Ze względu na wyczynowy charakter układu napędowego zadanie okazało się bardzo trudne i wersję produkcyjną udało się wprowadzić dopiero w 1996 roku. Skrzynię opracowała brytyjska firma Ricardo - mało znany lider w zakresie układów napędowych. Oprócz współpracy z Ferrari może pochwalić się także zaprojektowaniem i zbudowaniem skrzyni do zwycięskich prototypów Audi z 24-godzinnego wyścigu Le Mans jak i dwusprzęgłowej DSG z Bugatti Veyrona.

456 GTA zaprezentowano w marcu 1996 na salonie samochodowym w Genewie. Czterobiegowy automat dowiódł bardzo wysokiej jakości - przyspieszenie do 100 km/h jest zaledwie o 0,3 sekundy gorsze niż w przypadku skrzyni ręcznej - wynosi 5,6 sekundy. Mimo to, tylko co czwarty właściciel 456 decydował się na GTA.